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所謂合理避稅的目的也就是在合法的范圍內用合規(guī)的方式合理的降低企業(yè)稅收成本，在土地增值稅上，通常企業(yè)主要從兩方面入手，一是扣除項目，想辦法降低日常發(fā)生的各項支出，包括稅金；二是收入。
計算增值額的扣除項目主要包括：1、取得土地使用權所支付的金額。（1）以出讓方式取得土地使用權時，為支付的土地出讓金；（2）以行政劃撥方式取得土地使用權的，為轉讓土地使用權時按規(guī)定補繳的土地出讓金；（3）以轉讓方式取得土地使用權的，為支付的地價款。2、開發(fā)土地和新建房及配套設施的成本費用。（1）土地征用及拆遷補償費；（2）前期工程費；（3）、建筑安裝工程費；（4）、基礎設施費；（5）、公共配套設施費；（6）、開發(fā)間接費：直接組織、管理開發(fā)項目所發(fā)生的費用，包括工資、福利費、折舊費、修理費、辦公費、水電費、勞動保護費等等。（7）與房地產開發(fā)項目有關的管理費用、銷售費用、財務費用。3、轉讓房地產有關的稅金。主要有：營業(yè)稅、印花稅、城建稅、教育費附加。4、財政部確定的其他扣除項目。從事房地產開發(fā)的納稅人允許按取得土地使用權時所支付的金額和房地產開發(fā)成本之和，加計20％扣除。5、舊房及建筑物的評估價格。
股權轉讓成企業(yè)“合理避稅”法門
在實際操作中，企業(yè)通常會利用扣除項目及優(yōu)惠政策進行避稅。按照稅法規(guī)定，納稅人建造普通標準住宅出售，增值額未超過扣除項目金額的20％的，免征土地增值稅；增值額超過扣除項目金額20％的，應就其全部增值額按規(guī)定計稅。根據20％這個比率，企業(yè)可以對此進行納稅籌劃。首先要測算增值率（增值額與允許扣除項目金額的比率），然后設法調整增值率。改變增值率的方法有兩種：一是合理定價，如在銷售過程中增值率略高于兩極稅率檔次交界的增值率，通過適當降低價格可以減少增值額，降低土地增值稅的適用稅率，從而減輕稅負。二是增加扣除額，主要是通過加大投入來提高市場競爭力。
除此之外，利用股權轉讓方式出售房產也是近年來企業(yè)常用的手段之一，特別是一些大企業(yè)或上市公司。
比如，2009年，《經濟觀察報》就曾曝出華潤中國通過股權轉讓方式避稅上千億的消息。報道稱，2009年9月初，由華潤中國注資的一家國際地產基金公司“華潤中國地產成長基金”，收購了位于北京東城區(qū)東四危改小區(qū)沿街公建北區(qū)D5區(qū)“第五廣場”項目開發(fā)公司——北京第五廣場置業(yè)有限公司中方全部權益。
該項目由易達國際投資有限公司與北京中鐵泰博房地產開發(fā)有限公司合資，雙方權益分別為61.22%和38.78%，評估的所有者權益為317835.12萬元。中鐵泰博公司曾于6月在北京市產權交易所掛牌轉讓該宗交易的合作權益。該宗交易金額超過人民幣12億元，為北京房地產市場經歷金融危機以來少見的大單交易。
華潤中國為一家大型港資房地產公司，華潤中國地產成長基金自2007年開始，先收購項目開發(fā)公司中的外資部分——香港易達國際投資有限公司權益，隨后展開其中中方部分——北京中鐵泰博房地產開發(fā)有限公司權益的收購。由于中鐵泰博為央企身份，以及受到金融危機的影響，談判持續(xù)了兩年。
按照北京岳華德威資產評估有限公司的評估結果，標的企業(yè)所有者權益每平方米約合25570元（含地下部分）。2006年，項目地上寫字樓部分開盤銷售價格為3000美元/平方米，目前評估市價約為人民幣3萬元/平方米。
項目樓面地價1000多元/平方米，總建筑面積12.4萬平方米，其中轉讓部分約占40%，估算為5萬平方米，總價約12.4億元，按照土地增值稅清算計稅方式，假設每平方米可扣除的成本為8000元/平方米，那么轉讓部分總成本約4億元，增值額為8.4億元，增值幅度超過200%，其適用的土地增值稅最高稅率達60%，應繳納的土地增值稅總額為3.64億元。
假如該項目以土地轉讓方式轉移給華潤中國地產成長基金，那么成金額為12億余元的項目，就需要交納約占總成交金額30%的土地增值稅。不過，該標的轉讓部分采取了股權轉讓方式，由華潤中國地產成長基金和中鐵泰博房地產開發(fā)有限公司共同持股，分享租金等所有者經營收益，這樣就避免了高額的土地增值稅。
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