楊偉文覺得有制度方面的原因，因為營改增現在還在試點過程中，有相當部分的企業、行業還沒有完全納入營改增范圍內，所以企業在外購服務接受勞務的時候，還沒有拿到屬于營改增企業所提供的增值稅發票抵扣。比如說運輸企業還有其他類似過橋費等費用，以后慢慢擴大范圍之后，可抵扣的量會多。運輸企業原來營業稅是3個點，增值稅之后提高到11點，如果簡單從匯率的角度看是增加了稅負，要減輕稅負中間要有一個量的抵扣，隨著范圍的擴大，應該是可以減輕稅負的。對于廣州3%企業因“營改增”負擔加重的問題，楊偉文建議這些企業對增值稅稅改整個趨勢和未來的發展要多關注，盡早做一些長遠良好的規劃，在經營管理和經營模式方面進行調整。
營業140多萬元交了250萬元的稅金
很多企業反映，出口退稅是惠民的政策但是享受不到。在記者的調查采訪中，有企業稱，廣州國稅部門發函審批需要的時間過長，導致企業資金運作非常被動。
一家外貿企業的陳經理說：“去年我們和中山市的一個供貨商簽了個單子，三月份申報的函調，到了六月才批下來，這對我們資金供應影響很大。”因為少了這部分預算，導致企業在和供貨商的合作關系和信譽上也出現問題。供貨商因此不信任他們，這對他們小企業來說打擊很大，還大大增加了企業的運營成本。陳先生還告訴記者，函調時間過長，過程透明度不高，充滿不確定性，需多久才能收到退稅款項，企業始終不得而知。
楊偉文解釋，大部分企業出口退稅的貨物可以及時退稅，個別的企業和個別的出口批次不能及時給予。出口退稅面臨的形勢非常嚴峻，主要是騙取出口退稅現在非常隱蔽，而且手法也很多，出現了專業化、集團化、產業化趨勢，所以在整個出口退稅的管理和要求審批方面都非常嚴格。“1%可能會出現這種情況，但是1%對于企業來說也是100%。”楊偉文承諾，下一步他們在辦事透明等方面繼續努力。
記者在調查走訪中發現，有時候中小企業得不到政府的支持，有時候是信息不對稱導致的，但是有的企業得到扶持之后，仍然很難生存。某再生能源企業法人梁浩平反映稱，大多數廢棄玻璃都是從環衛工人和普通市民那里回收的，他們無法給企業出具發票，而企業在出售產品時又需要向購買方提供發票。這樣，增值的部分得不到有效票據的證明，導致重復征稅嚴重。
梁浩平說：“雖然我們虧損，但是政府對垃圾分類和再生能源的號召卻一直在繼續，我們的業務量也在與日俱增。但是利潤只有這么一點，再加上稅收的重復。我們是垃圾分類首個試點企業，去年做了3萬噸，總體做了140多萬元，去年交了250萬元的稅金。原來政府準備答應給予補貼，但是還沒落實。如果我們繼續這樣做，越做越虧，真的堅持不下去了。”
梁浩平介紹，目前政策只是扶持回收利用的企業，政府讓他們回收居民的廢棄玻璃，他們作為下游企業，不能達到政府退稅的條件，但他們做的是分解城市垃圾，希望政府在增值稅或者是扶持方面給予多多支持。楊偉文回應稱，這個企業反映的情況非常現實，碰到問題也可以理解。政府扶持后，企業仍然經營艱難，他覺得在稅收服務方面還存在一些問題。廣州國稅局承諾會盡快了解詳細情況，并與企業一起分析出現的問題，一起探討改善企業現狀的方法。另外企業向個人收購的廢舊玻璃無法取得抵扣發票，國稅局會積極向上級反映，爭取在政策上有支持。
3年來共查處1200戶使用假發票企業
納稅和發票是兩個“孿生兄弟”，完全分不開，也有很多市民反應，有一些企業偷稅漏稅現象很普遍。記者在暗訪中來到到石牌路以純店，詢問要買這件衣服，能不能開發票？以純店員說，可以開小票，但是發票沒有。因為要去總店才有發票，他們這里沒有。
另外一種情況就是有票但不開，各種推脫，不及時開票。在石牌路某服裝店。記者詢問“有沒有發票？”店家回答：“有，但是要等。”至于要等多久？店家說要“幾個星期。”
第三種情況是有發票，但是要消費者花錢購買。在一家煙酒店，記者要求開發票，店家同意開，但是要加6個點。一家電腦店也是表示開發票可以，但是要加錢。最后一種情況就是開的發票不是本店的發票。在優加店內，發票開出來以后，記者一看是隔壁以純店的發票。
楊偉文稱，發票的管理一直是稅務的難點和重點，記者所反應的情況，歸類為兩方面，一是商家以各種的托詞和理由不開發票，二是虛開發票。不按規定開發票，這危害了稅收的秩序，也損害了消費者的合法權益，作為稅務部門，對發票的違反規定，或者是違法行為一直都是嚴加管理的。楊偉文解釋，發票的管理有很強的反復性和反彈性，因為現在管理的企業有70多萬戶，每天的經營業務量都很大，他們不可能派人盯在那里讓他開發票，加大管理雖然能，從整個面上有一些改善，但是沒有根本性的改善，這也是他們的責任所在，下一步將加強管理。但是他覺得下一步應該是加強稅收宣傳，讓納稅人依法納稅，誠信納稅，同時希望消費者在交易的時候，不管報銷與否銷都要拿發票。
稅務局稽查處回應，市民在購物消費的時候商家不按規定開發票的行為是違法的，市民遇到這種情況可以向廣州市國家稅務局稽查局舉報中心舉報，市民可以來人，來信，來電進行舉報，也可以登錄廣州市國家稅務局網站進行舉報，舉報電話是12366。
目前，國稅局的監管有兩個方面，第一，對不按規定開發票的商戶進行監管，也對使用假發票，制假售假的源頭進行監管，對制假售假的聯合公安對他們進行打擊，今年打擊27個窩點，抓了133人。同時，對稽查部門來講，他們對使用假發票的企業進行嚴肅查處，3年來共查處1200戶企業，涉及的稅額有6億多。對網絡上兜售假發票的網頁進行收集，移送公安部門進行處理。
