千萬別小瞧每月收到增值稅的專用發票抵扣聯后要認證這件事！明日復明日是很危險的!
請注意以下的風險環節：
1.認證期限是開票之日(開票日當天，即算一天)起180日內，過期不候。
根據國稅函[2009]617號第一條，增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發票、公路內河貨物運輸業統一發票和機動車銷售統一發票，應在開具之日起180日內到稅務機關辦理認證，并在認證通過的次月申報期內，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。第二條則規定了實行海關進口增值稅專用繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關繳款書，應在開具之日起180日內申請稽核比對。
另外財稅[2013]106號文中，第二十二條提及從銷售方或者提供方取得的增值稅專用發票（含貨物運輸業增值稅專用發票、稅控機動車銷售統一發票，下同）上注明的增值稅額，可以從銷項稅額中抵扣，此抵扣認證期限也應為開具之日起180日內。
對于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題在國家稅務總局公告2011年第50號中有詳細規定，只有基于真實交易且由于客觀原因造成的逾期未抵扣憑證才可能通過層層關卡獲得抵扣。顯然這不是件容易的事，還是及時認證更靠譜。可惜50號公告沒有提機動車銷售統一發票的事。
并非所有的增值稅扣稅憑證都有認證或申報抵扣期限，目前稅法未規定抵扣期限的增值稅扣稅憑證包括：
（1）購進農產品，取得的農產品收購發票或者銷售發票；
（2）接受境外單位或者個人提供的應稅服務，從稅務機關或者境內代理人取得的解繳稅款的中華人民共和國稅收繳款憑證。
2.本月認證還是后期認證，這是一個不老的警示。
如果本月收到的抵扣期內的抵扣聯未及時認證，而當月的開票金額很大，造成進項稅額遠小于銷項稅額，下月可得交大額稅款了。當然也有故意將本月收到的發票留待后期認證的情況，那就另當別論了。
此時可以考慮留抵抵欠稅的方式處理，不過呢，要注意操作的技術處理與滯納金的問題!
非常鄭重的說明，增值稅抵扣可沒有節假日的問題，即不因最后一天是節假日順延的征管法的適用，嚴格按照公歷的最后一天來把握，這一點是非常有用的忠告。
3.認證前需剔除那些明顯不屬于可抵扣項目的發票。
如果一時難以確定，可先行認證抵扣著，后期做進項稅額轉出。要是后來明確了要抵，但過了抵扣期，就要難受了!
4.認證時出點意外可得眼巴巴跑趟稅務局。
如果首次認證未通過，可不能再次掃描，只能在查詢狀態下做修改，并再次上傳認證，否則就得去稅務局認證了。或是第二次接收認證結果后仍提示“認證未通過”，這張發票只能拿到所屬稅務局窗口進行認證。
5.為了避開紅票，必須爭分奪秒退票。
有時會收到問題發票，比如發票本身的號碼和開具時的號碼不一致，或是發票印刷的密碼區有問題而無法認證，遇到這類情形要先檢查開票日期，如果是本月開具的應果斷將發票退回給開票方作廢重開，千萬別留到下月，跨期就只能申請開紅票了。
以下是增值稅專用發票（包括貨運發票）的認證流程舉例：
1、進入“中興通抵扣聯信息采集系統”，發票類別選擇“增值稅專用發票”或“貨物運輸發票”，登陸后進入主界面。
2、單擊系統主界面上的“發票錄入”按鈕，彈出“發票錄入”界面，可選擇“手工錄入”或“掃描錄入”。
3、如果每月需認證的增值稅發票數量不多，未購買配套掃描儀，可選擇手工錄入方式；企業每月需認證的增值稅發票數量較多，可掃描錄入。掃描錄入方法：先將增值稅專用發票正確放入掃描儀中的指定位臵，再單擊“掃描錄入”按鈕，錄入的發票信息顯示在發票明細列表中。
4、發票錄入后，進行上傳稅局認證。返回主界面，單擊“上傳稅局認證”按鈕，彈出“上傳稅局認證”界面。
5、勾選將要上傳的發票信息后，單擊“上傳稅局認證”按鈕，彈出“選擇傳輸方式”對話框，選擇“網絡傳輸”，勾選“是否自動接收結果”后單擊“確定”；然后出現“提示”，單擊確定。
6、稍微等待一會，出現提示框，顯示認證結果。
7、如果有發票首次認證未通過，需進行修改并保存，再次進行上傳。單擊主界面上的“查詢統計”按鈕，彈出“發票查詢統計”界面；單擊“查詢”按鈕，彈出“查詢條件”對話框，將“當前狀態為”選擇成“首次認證未通過”。
8、出現首次認證未通過的發票信息，單擊“修改”按鈕，彈出“增值稅發票[修改]”界面。
9、對照紙質發票仔細進行核對并修改錯誤信息，單擊“保存”按鈕，彈出“發票修改成功”對話框，單擊“確定”按鈕。返回系統主界面，第二次進行上傳和接收步驟。如果第二次接收認證結果后仍提示“認證未通過”，這張發票只能拿到所屬稅務局窗口進行認證。
10、網上認證用戶次月1日9：00以后即可自行打印認證結果通知書。單擊主界面上的“發票管理”菜單。選擇下拉菜單中的“打印通知書”，打印方式選擇“按屬期打印”，數據來源選擇“從服務器打印數據”后單擊“確定”，出現通知書管理界面，單擊“打印”按鈕，即可打印出《認證結果通知書》。
貨物運輸發票的認證過程同上，只是在進入認證系統主界面后發票類型選擇“貨物運輸發票”。
