某市××科技有限公司（以下簡稱A公司），中外合資經營企業，由某市××集團公司（以下簡稱B公司）與英國某公司共同投資創建。B公司以其生產經營性資產（機器設備、存貨、應收賬款等）作為投資，占股權75%。A公司職工均是B公司的老員工，并租賃B公司的廠房進行生產經營。經營范圍：工程機械零部件制造、研發和銷售。2014年5月注冊成立，同年6月認定為增值稅一般納稅人。
A公司2014年度實現銷售收入9855.34萬元，繳納增值稅180.35萬元，增值稅稅負1.83%；2015年度實現銷售收入18367.44萬元，繳納增值稅227.75萬元，增值稅稅負1.24%，同比下降0.59個百分點，與某市同行業平均稅負相比低0.74個百分點。針對這個疑點，2016年6月主管稅務機關對該企業進行了納稅評估。
面對評估人員，企業財務人員痛快地承認了幾個問題：一是職工食堂、宿舍耗用水電費抵扣的進項稅額沒有轉出，二是處理舊設備沒有按簡易辦法繳納增值稅，三是發出商品沒有開票未及時計入銷售收入，自查補稅12萬元。企業如此配合，是不是要掩蓋更大的問題呢？
進一步查看A公司財務報表，發現2015年管理費用2021萬元，為什么費用這么高？財務人員有些緊張，解釋說主要是支付給B公司的租賃費。A公司的廠房是租賃B公司的，人員也都是從B公司過來的，為了給B公司增加一些利潤，定的租賃費稍微有點高。財務人員出示了兩公司的租賃合同，證明確實為正常租賃費支出。
帶著疑問，評估人員繼續翻看企業的記賬憑證，突然發現某月支出租賃費，會計分錄如下：
借：管理費用——廠房租金 1000000
應交稅費——應交增值稅（進項稅額） 170000
貸：銀行存款 1170000
廠房租金里邊怎么能有增值稅進項呢？再查看其原始憑證居然是增值稅專用發票，其“貨物或應稅勞務名稱”是“勞務費”！看到評估人員這一重大發現，企業財務人員更加緊張。原來，B公司長期虧損并且增值稅留抵巨大，而A公司是新辦企業，沒有采購新設備，增值稅稅負偏高。因此，從2015年1月份開始企業實施這樣的稅收籌劃，由B公司向A公司開具增值稅專用發票，A公司能抵扣進項少繳稅款，B公司也不需納稅，兩企業實現“雙贏”。
企業財務人員解釋說，原以為2015年就全面實施營改增了，租賃費也開始征增值稅了，A公司抵扣進項，B公司計提銷項，總體沒有少繳稅款。只是在評估前幾天培訓時，才明白“有形動產租賃”從2013年8月1日開始實施營改增，“不動產租賃”2016年5月1日營改增，一直惴惴不安又心存僥幸不被發現，沒想到還是被稅務人員發現了。
經過企業自查和稅務人員核實，2015年A公司支付B公司租賃費728.94萬元，抵扣增值稅進項稅額123.92萬元；2016年1月～4月支付租賃費243.12萬元，抵扣增值稅進項稅額41.33萬元；A公司共補繳增值稅177.25萬元，其中2015年度135.92萬元，2016年1月～4月41.33萬元，加收滯納金16.6萬元。補繳稅款后，企業2015年增值稅稅負達到1.98%，同比增加0.15個百分點，與全市同行業平均稅負基本持平。同時，稅務機關根據《發票管理辦法》對B公司違規開具增值稅專用發票的行為處以1萬元罰款，并按照國地稅合作規范，向地稅部門提供了征管線索。
